חניתה מסמלת את שיאו של מבצע 'חומה ומגדל'. העלייה לקרקע במקום מרוחק ומבודד בלב אזור עוין ובעיצומם של 'המאורעות' עוררה רושם עז ביישוב היהודי, והפכה את חניתה לסמל לאומי של ההתיישבות החדשה בארץ ישראל. במוזיאון מוצגים אירועי התקופה, סיפור העלייה לקרקע ושנותיו הראשונות של הקיבוץ.
